公表されたイクイノックスの種付け相手は203頭。G1・9勝のアーモンドアイを筆頭に、クロノジェネシス、ストレイトガール、ソダシ、ノームコア、ユーバーレーベン、リスグラシュー、レーヌミノル、レシステンシア、サークルオブライフ、ショウナンアデラなど現役時代にG1を制した名牝や、ダストアンドダイアモンズ（ドウデュースの母）、チェッキーノ（チェルヴィニアの母）、ケイティーズハート（エフフォーリアの母）、クイーンオリーブ（ペプチドナイルの母）、マーゴットディド（ジャスティンミラノの母）、メーヴェ（タイトルホルダーの母）、メモリアルライフ（シャンパンカラーの母）、ヤンキーローズ（リバティアイランドの母）、アタブ（ルガルの母）、アスコルティ（アスコリピチェーノの母）など、G1馬の母馬、また、それ以外にも第1回サウジC覇者になったミッドナイトビズーなど海外でG1を制した名牝、海外でG1馬を生んだ母馬、他にも九州産馬でJRA重賞制覇を果たしたヨカヨカなど、各牧場の期待の繁殖牝馬が名前を連ねている。
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